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KTA蛋白层析系统延迟体积的确定与设置

来源:Cytiva(思拓凡)      分类:操作使用 2024-03-21 10:34:30 9阅读次数



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?KTA蛋白层析系统的流路自身包含一定管路体积,这部分管路体积又称为延迟体积。延迟体积依据位置不同可以分为梯度延迟体积和收集延迟体积,本文将对以上两种延迟体积定义延迟体积确定方法UNICORN系统中延迟体积的设置进行详细介绍


梯度延迟体积(Gradient delay volume)


梯度延迟体积是指设置梯度程序时混合池与层析柱入口之间的体积,这部分管路体积会导致层析柱中真实梯度与程序中的梯度 (%B curve) 出现一定的延迟(图1)。梯度延迟体积可以通过理论计算和实验测定的方法获得,在使用特定混合器的层析系统中梯度延迟体积是一个定值,不会随着使用层析柱体积大小发生改变。对于离子交换等通过拉梯度方式进行洗脱的层析方法,进行梯度优化时尤其要注意,样品洗脱峰对应B%浓度,是此时混合池正在混合的梯度,并非样品被洗脱当时进入柱子的B%盐浓度。此时,可以用开始给混合池梯度命令(绿色线起点)和电导检测器检测到电导值开始增加(蓝色线起点)之间的体积差,近似作为梯度延迟体积,用于倒推样品洗脱时对应的B%浓度。


图1. 真实梯度(蓝色)对比程序梯度(绿色)


收集延迟体积(Fraction delay volume)


?KTA系统收集延迟体积指UV检测器到样品收集器或者UV检测器与outlet之间管路的体积(图2)。


图2. 蛋白层析系统?KTA系统延迟示意图


?KTA蛋白层析系统收集样品时,需要在系统中准确设置收集延迟体积从而避免因为收集延迟体积错误,造成?KTA紫外峰图显示的样品出峰位置与对应的收集管发生错位的现象(图3)。图3中(a)图没有收集设置延迟体积导致SDS-PAGE胶图与UV峰图相比出现滞后现象;而(b)图中准确设置收集延迟体积,SDS-PAGE胶图与UV峰图可以较好的进行对应[1]


图3. 系统延迟体积设置对收集位置的影响[1]


收集延迟体积确定方法


系统延迟体积可以通过理论计算和实验测定的方法进行确定,以下将对两种延迟体积确定方法分别进行介绍。


01

收集延迟体积理论计算方法


理论计算是获得延迟体积较简便方便的方法,延迟体积理论计算包括以下3个步骤:

 1 

确定设备系统流路中所有成分部件。

 2 

查表确定系统流路中各个硬件单元(?KTA pure User Manual 9.14章节)和单位长度管路对应体积(表1)。

 3 

计算系统延迟体积:将混合池体积与连接层析柱管路体积相加即获得梯度延迟体积;将UV检测器样品流通池的1/2体积(UV检测器检测点为流通池中心区域)与流路中其它硬件与管路的体积进行加和,得到收集延迟体积。


注:pH阀V9-pH和V9H-pH对应体积一般以阀门在bypass位置的体积计算,如果pH阀inline系统会自动计入限流器和pH流通池的体积。


表1. ?KTA系统不同内径管路应用及单位长度管路内部体积


02

收集延迟体积的实验测定方法


UV吸收值测定法

连接F9-R和F9-T收集器的?KTA pure系统(图3)可以通过UV吸收值测定的方法得到,通过测定V1(样品入口与UV检测器之间体积)、V2(样品入口到收集器样品出口端之间的体积),计算V2-V1+1/2V(V为UV检测器流通池体积)获得延迟体积[2][3]。具体实验步骤如下:

 1 

设置系统流速1 ml/min(如果流速不准确,检查系统泵是否进气,继续实验前确定流速的准确性)。

 2 

使用1%-5%丙酮溶液充满样品环(例:样品体积100 μl)。

 3 

设置UV检测器到收集器之间所有部件为bypass模式。

 4 

用水充满系统管路,设置流速1 ml/min,用样品环中丙酮溶液为样品上样。

 5 

计算从样品注入点开始到层析图谱紫外吸收最高点流路体积,即为V1。

 6 

重新配置系统流路,将收集器置于UV检测器之前。断开UV检测器两端管路,用死体积较小的连接头将两端管路连接起来。收集器出口管路连入UV检测器,UV检测器出口端接入废液口Waste。

 7 

设置一个较大的收集体积(比如100 ml),保证实验过程中样品从收集口流出。

 8 

设置流速1 ml/min,加入样品丙酮溶液。

 9 

计算从样品注入点开始到层析图谱紫外吸收最高点流路体积,即为V2。

 10 

依据公式计算V2-V1+1/2V(V为UV检测器流通池体积),获得延迟体积。


注:该方法不适用?KTA avant蛋白层析系统,因为用户无法拆掉其样品收集器连接的管路。


图4. (A) ?KTA pure蛋白层析系统(B)F9-R收集器(C)F9-T收集器


称重法

通过称量水的重量测定收集延迟体积(容器重量需要预先称重)[3]

 1 

设置系统流路从UV流通池直接流向收集器。

 2 

用鲁尔接头替换UV检测器入口接管。

 3 

用注射器将UV流通池到收集器尖端整个管路用水充满。

 4 

使用注射器用空气将UV流通池到收集器尖端整个管路中的水完全替换出来。

 5 

通过称量水的重量测定收集延迟体积。

 6 

重复3次实验取平均值。


标准配置的?KTA pure收集延迟体积


标准配置、使用标准长度管路的?KTA pure设备,其设备标准延迟体积数据已在?KTA pure使用手册中列出。手册中延迟体积数据是依据U9-M紫外检测器计算,如果使用U9-L紫外检测器需要在此体积基础上加9μl (2mm流通池)、4μl(5mm流通池)。

标准配置?KTA pure Micro/Micro kit配置微量紫外检测器、微量电导检测器和微量出口阀。

标准配置的?KTA pure系统可以通过查询对应表格(表2、表3和表4)得到标准配置设备收集延迟体积信息。

其他型号标准配置的?KTA蛋白层析系统也可以通过查询使用手册获得设备标准收集延迟体积。


表2. ?KTA pure25收集延迟体积


表3. ?KTA pure Micro/Micro kit收集延迟体积


表4. ?KTA pure 150收集延迟体积


UNICORN系统中收集延迟体积的设置


UNICORN系统中可以设置UV检测器到Outlet阀及UV检测器到收集器之间的延迟体积(图4),具体设置步骤如下:

 1 

在System Control界面选择System-Settings,打开System Settings对话框。

 2 

点击 Fraction collection →Delay volumes。

 3 

在Detector-Frac 中输入UV检测器到收集器之间的延迟体积数值;在 Detector – Outlet中输入UV检测器到出口阀之间的延迟体积数值。


注:系统使用对应配置的延迟体积时会自动忽视其他设置的体积(比如使用收集器收集时,UV检测器到Outlet阀的延迟体积数值将被忽视)。因此建议设置各部分延迟体积,以便在更改收集方式时保证延迟体积的正确性。


图4. UNICORN系统延迟体积的设置界面


需要说明的是不同型号的?KTA蛋白层析系统延迟体积的确定和设置方法,操作细节上可能存在细微差别,具体设置方法可以查看对应型号产品的使用手册。


参考文献:

1. 芦亚菲. 《蛋白质制备与鉴定平台蛋白层析系统介绍》清华大学蛋白质研究技术中心蛋白质制备与鉴定平台 2020/05/16 https://phoenix.tsinghua.edu.cn/index.php?c=show&id=519

2. ?KTA pure User Manual 29119969 AE

3. ?KTA Laboratory-scale Chromatography Systems CY13989-02Dec20-HB. Appendix 3 Determination of delay volumes


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最近更新:2023-09-18 16:20:36
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