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用这个软件分析孔板阵列数据也太方便了吧!

来源:Cytiva(思拓凡)      分类:选购指南 2024-04-02 11:00:08 16阅读次数


Amersham ImageQuant TL (IQTL) 分析软件作为一款通用的多功能成像结果分析软件,可支持包括条带面积区域孔板阵列以及克隆计数在内的成像结果分析。可支持导入的文件格式包括:

 1 

TIF/TIFF (8bit/16bit)

 2 

GEL, IMG(分别为Amersham Typhoon输出的原始格式及图片格式)

 3 

DS(IQTL输出的多通道叠加的图片格式)

 4 

JPG, JPEG, PNG(不建议用于定量分析)

那么问题来了,如何用IQTL软件将孔板图片转化为有用的数据分析结果呢?


按照以下步骤即可快速完成数据处理



1

打开主界面上的“Array Analysis”功能。在新界面上点击右侧的“Open”,打开想要分析的图片。


2

界面左侧为分析步骤。“Image”中将图片对比度调节到合适范围后,按照分析步骤从上到下的顺序点击“Grid”进行样品孔划定

首先在“New Grid”选项下,输入孔板每行和每列的孔数,也可以选择系统内预置的96孔板或384孔板数据。通过鼠标单击拖拽,生成样品孔阵列,如有偏移可通过“Edit Grid”或“Edit Well”让每一个红色圆圈对准图上一个样品孔。


3

在分析步骤中选择“Background”,选择合适的方法进行背景扣除。下方表格中的数据对应单个孔中扣除背景之后的灰度值。

4

IQTL还可以支持一些进阶数据分析。如果需要对数据进行归一化计算,可点击分析步骤中的“Normalize”,选中参考孔后,在右侧窗口中点击“Set Reference Well”,并在下拉菜单中选择参考值,之后左侧表格中会显示设置后的每孔的相对值。

5

如需对数据进行定量计算,可点击分析步骤中的“Quant. Cal.”。在图中选择已知含量的孔,在右侧窗口中点击“Add”,在下方“Known Value”中输入已知数值。当输入三个孔及以上的已知数值时,软件将自动计算并根据设置的曲线类型进行拟合。在下方表格中可读出计算出的每孔对应的数值,在右侧窗口下方可读出对应公式。


6

如需对数据进行阴阳性比较,可点击分析步骤中的“Presence”。点击需要设置为对照的孔,在右侧点击“Selected is present/Absent”,设置选中的孔为阳性孔 (present) 或阴性孔 (Absent) ,软件将按照每孔信号值的强弱,以设定孔为基准,强度高于设定孔即为Yes,强度低于于设定孔即为No。在图片下方的表格中可读出结果:


以上就是孔板分析操作流程,非常方便简单。想解锁更多Amersham ImageQuant TL (IQTL) 分析软件的功能请点击文末“阅读原文”了解详情,扫描下方二维码更有试用软件可以领取哦~


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最近更新:2023-09-18 16:20:36
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